Philippe Gonon, conseiller municipal UDI de Besançon et candidats aux élections départementales, estime que Jean-Louis Fousseret « manipule » les chiffres du coût du tramway. Aux 246,4 millions d'euros portés par la communauté d'agglomération, l'élu d'opposition ajoute 19,4 millions dépensés par la ville pour les travaux d'accompagnement dont il a demandé et obtenu communication, et parvient à 265,8 millions. « Nous sommes loin de ces ridicules 228 millions survendus pendant les années 2008-2014 », écrit-il en parlant de « dissimulation indigne ».
La CAGB a toujours parlé de 228 millions, valeur 2008, plus ou moins 5%. Actualisés en 2015 en tenant compte de l'inflation (10,3% de janvier 2008 à décembre 2014), ces 228 millions correspondent à 251 millions. Avec la marge de +5%, on arrive à 263,55 millions... Le premier vice-président de la CAGB, Gabriel Baulieu, n'évoquait quant à lui pas 251 millions, mais 255.
Philippe Gonon est constant dans sa critique du coût du tram.