Europe Ecologie Les Verts présente des listes dans trois cantons de l’agglomération bisontine :
Besançon-2 : Cécile Prudhomme et Pierre Chupin (titulaires)
, Dominique Petit-Jouffroy et Emilien Moussard (suppléants)
.
Besançon-3 : Eliane Paulin et Claude Mercier ; Pauline Jeannin et Claude Girard.
Besançon-4 : Corinne Tissier et Christophe Moyse ; Mathilde Tessier et Michel Boutanquoi.
Les discussions locales avec différentes forces de gauche n'ont « pas pu déboucher sur des candidatures de large rassemblement », indique EELV qui ne sera pas présent sur les cantons Besançon-1, Besançon-5 et Besançon-6 afin « d'empêcher le basculement à droite du département et maintenir le dialogue ». Dans le canton Besançon-3, le PS ne présente pas de candidats, Eliane Paulin est « société civile » et Claude Girard est conseiller général PS sortant : « on y va pour gagner », assure Anthony Poulin, coordinateur de la campagne d'EELV. Un accord avec le PS réserve un canton aux écologistes, ce qui avait permis à Eric Alauzet d'être élu en 2008 sur le canton de Besançon-est qui comptait, outre une partie de Besançon, Chalezeule et Chalèze qui ne sont pas dans le nouveau canton de Besançon-3. Eric Alauzet avait démissionné après son élection à l'Assemblée nationale, laissant son mandat à sa suppléante Patricia Olivares.
EELV n'entend pas « masquer les divergences avec la politique gouvernementale (réforme territoriale, baisse des dotations aux collectivités…) » et développera au cours de la campagne « des propositions concrètes et positives pour un département plus écologique et plus solidaire qui améliorent la qualité et le cadre de vie et favorisent le bien-être des habitant-e-s ». Les divergences avec le Front de gauche, plus particulièrement le Parti de gauche sur les relations avec le PS, n'ont pas pu conduire à des quadrinômes communs sur Besançon.
